卵巢巧克力囊肿该疾病无明显并发症。患者在日常生活中应留心自身症状，病情进展或有复发倾向者应及时就医。长期用药者，还需注意观察是否有药物不良反应出现。

卵巢巧克力囊肿预防的作用有限，但是通过及时治疗生殖道异常的疾病、口服避孕药、定期锻炼等，可能会降低发病风险。

卵巢巧克力囊肿患者在日常生活中可进行温水浴和热敷下腹部来促进血液循环，减少疼痛，但长期应用热敷可能在腹部皮肤留下暗褐色素沉着，影响局部美观。

定期体育锻炼不仅可以促进血液循环，而且还能释放缓解疼痛的内啡肽。低强度的锻炼（比如瑜伽）也可以通过拉伸骨盆的组织和肌肉来缓解疼痛。

正确饮食，避免吃辛辣刺激性食物。

如果症状复发或者囊肿再次复发，患者应遵医嘱每3～6个月接受1次随访。

医生会重点随访症状控制情况、生活质量、囊肿情况、有无药物副作用、卵巢囊肿良恶性质的监测等。

随访内容包括妇科检查、盆腔超声检查、卵巢肿瘤标志物、卵巢功能等，对于连续使用GnRH-a6个月以上的患者，应定期到医院测定骨密度。

有关特殊注意事项，若进行保留生育功能手术治疗，术后复发率约40%，因此术后宜尽早妊娠或遵医嘱使用药物以减少复发。

由于本病的病因尚不明确、多因素起作用，预防作用有限。针对发现的某些高危因素，采取相应的措施，可能减少本病的发生。

及时发现并治疗先天性生殖道畸形、闭锁、狭窄和继发性宫颈粘连、阴道狭窄等，避免经血流出不畅。

口服避孕药可降低本病的发生风险。因此对有家族史、容易带器妊娠者可选择药物避孕。

月经期患者应注意避免做妇科检查，月经前不要做输卵管通畅试验，以免将内膜碎屑推入腹腔。

晚婚的妇女，尤其是伴有月经失调和痛经者，应尽早生育，如果婚后1年没有生育者应行不孕症的有关检查。